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目前在全基因组范围内做variants calling的软件还是GATK，Samtools为主，我之前的工作基本上属于这两个都用一点，昨天需要跑一批数据的时候发现GATK更新了，很多命令和参数都有了改变，觉得再去看manual就很麻烦，反正都是看不如就学习一下最近非常火的sentieon。 Read More...

很久没有写过博客了，看见二师兄在群里征集课题组网站的资料我也方然想起来自己曾经也花了很多时间建立的一个博客，既然是心血，那就还是要继续督促自己写下去。 Read More...

转录组分析算是比较常见的生物信息分析内容，加之最近确实有课题与之相关，无论如何，花些时间自己做一遍增加理解也可以接受. Read More...

再也不是任何意义上的闲来无事了，迫不得已要自己重新分析转录组数据，虽然这套流程在学界早已非常成熟，但对于新手来说每一步并不是想象的那么简单，特别是对于非模式生物的各类数据分析。简单记录一下自认为值得注意的地方。 Read More...

发现Github这个网站大概是在一年前了，由于某些原因，在课题开展的过程中或多或少的会需要用到一些用的计算机相关知识，偶然间发现Github这个网站，上面分享了非常多实用的，有趣的工具，刚开始觉得特别的炫酷（现在也是），后来就花了很短时间慢慢研究了一下，估摸着还算不上浅尝辄止， Read More...

近来在学习基于SNP标记的关联分析相关的内容，对于GWAS与基于连锁遗传的QTL定位之间有什么本质区别一直有点迷迷糊糊，从网上看到了一篇文章，感觉部分地解决了疑惑。 Read More...

原本计划对几个亚洲棉基因进行blast比对寻找在陆地棉中的同源基因，但是服务器抽风了，导致计划被打乱，不过刚好也乘此机会学习和总结一下BLAST+的安装和使用。
本文实测环境为Linux64位系统。 Read More...

刚刚接触评论系统，上网一搜发现普遍采用的第三方评论系统“多说”已经在今年6月阵亡了。幸好我的主题还能够支持另外一种评论系统——Disqus。目前这个博客使用apollo主题搭建，支持Disqus和duoshuo系统，尽管想要做的简洁一些， Read More...